论文查重会查开题报告的，对于开题报告，知网查重是依据连续出现13个字符类似就会判为重复，换句话说超出13个字类似就会被系统软件标红，计算到重复率当中。知网查重时，黄色的文字是“引用”，红色的文章是“涉嫌剽窃”。知网查重系统软件反复率是有阈值的，知网的阈值大约是5%，超出这一阈值，论文就会被知网系统判定为不合格。

开题报告是什么呢?先跟大家说说开题报告的含义，开题报告是指开题者对科研课题的一种文字说明材料。开题者把自己所选的课题的概况(即"开题报告内容")，向有关专家、学者、科技人员进行陈述。然后由他们对科研课题进行评议，再由科研管理部门综合评议的意见，确定是否批准这一选题。

一般情况下，开题报告是不查重的，通常只有论文全文才需要查重，不过如果将论文的开题报告放进论文中的，那么也是会检测重复的，因为既然将开题报告上传了，那么也是包含在查重范围中的。

虽然论文的开题报告很少查重，但是有部分机构也是会要求查重的。所以，大家最终还是要以学校或者期刊出版社的具体要求为准，有些机构明确规定要查重论文开题报告的话，那么大家就要将自己的开题报告同论文一起提交查重。

除了开题报告之外，一般论文中的页眉页脚、参考文献和附录部分也不会查重，所以大家要着重留意机构是否明确规定这些部分要检测重复率。