两者所使用的查重系统不一样，学术查重所使用的是学术内部查重系统，包括本科、硕博、期刊等查重系统，而万方检测系统虽然也包括本科、硕博、期刊等查重系统，但是两者的查重系统库是略有差别的，学术系统库所收录的文献内容会和万方所收录的不同，但是即使不一样，用户也可以根据自己的需求选择学术或者万方系统进行论文查重。
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